SMP A. WAHID HASYIM Memiliki Program Unggulan di antaranya:
- Tahfidz 3 Juz (Juz 30, Juz 1, Juz 2 dan untuk yang sudah Tahfidz bisa melanjutkan ke Juz berikutnya).
- Kepesantrenan (Belajar Membaca dan Menulis Huruf Pego serta memaknai kitab)
- Ke NU-an Aswaja (Pembiasaan sholat dukkha, sholat dhuhur, sholat ashar berjama’ah. Pembiasaan tahlil, istighosah, diba’, rotibul hadad secara rutin. Pembiasaan membaca surat Yasin, al-Waqiah, al-Mulk. Pembiasaan BTQ ( baca tulis Al-Qur’an ) setiap hari.)
- Enterpreneurship atau Kewirausahaan berguna dalam membantu individu yang 'tidak' memiliki jiwa kewirausahaan, dapat membangun rasa percaya diri, mengembangkan kreativitas dan inovasi serta berani mengambil risiko.
- Pembelajaran Berbasis IT Dengan mempelajari Informatika, siswa dilatih untuk menguasai suatu teknologi dan diharapkan dapat menciptakan teknologi baru. Hal inilah yang mendasari Informatika menjadi bekal untuk masa depan siswa.
- Language Day dengan tiga Bahasa yakni Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris dan Bahasa Jawa.